Мистер Фалуэлл-младший пришел на критику после того, как опубликовал в Instagram свою фотографию с расстегнутыми брюками.
Деловой партнер также утверждал, что был вовлечен в сексуальные отношения с мистером Фалвеллом-младшим, который возглавляет университет свободы, и его женой.
В колледже действует строгий кодекс чести, запрещающий сексуальные отношения "вне брака, предписанного Библией".
Вокальный сторонник президента США Дональда Трампа, мистер Фалуэлл-младший занял пост в колледже в 2007 году после смерти своего отца Джерри Фалуэлла.
Г-н Фалуэлл-старший основал университет в 1970-х годах, а также консервативное движение Морального большинства.
Джерри Фалвелл-младший впервые взял бессрочный отпуск в Университете свободы в начале этого месяца после того, как опубликовал в Instagram свою фотографию с расстегнутыми брюками.
В понедельник американские СМИ сообщили, что он подал в отставку, ссылаясь на чиновников из этого учреждения. Мистер Фалуэлл-младший опроверг эти сообщения, заявив сайту Politico news, что они не соответствуют действительности.
Университет опубликовал заявление, в котором говорилось, что г-н Фалвелл-младший изменил свое мнение: "в первый день занятий осеннего семестра университета свободы Джерри Фалвелл-младший согласился уйти с поста президента и из Совета директоров, но после сообщений СМИ об отставке отозвал его."
В дальнейшем развороте Мистер Фолуэлл-младший в конце концов подтвердил ABC News и The Wall Street Journal, что он подал в отставку.
Исполнительный комитет и правление евангелического колледжа заявили, что соберутся во вторник, чтобы обсудить этот вопрос.
Мистер Фалвелл-младший уже был под пристальным вниманием из-за фотографии, которую он опубликовал в интернете в начале этого месяца. Он появился в кадре с расстегнутыми брюками и рукой, обнимающей женщину.
Изображение вызвало возмущение и обвинения в лицемерии со стороны политических правых и левых, и Университет свободы попросил мистера Фалвелла взять "бессрочный отпуск" вскоре после этого.
Появились новые обвинения. Джанкарло гранда, деловой партнер Фалвелла-младшего, сообщил агентству Reuters в понедельник, что у него были шестилетние сексуальные отношения с евангельским лидером и его женой Бекки Фалвелл.
У нас с Бекки сложились интимные отношения, и Джерри с удовольствием наблюдал за ними из угла комнаты, - сказал мистер гранда в интервью.
Кодекс чести колледжа гласит, что"сексуальные отношения вне библейского предписанного брака между прирожденным мужчиной и прирожденной женщиной не допускаются в Университете свободы".
Адвокат мистера Фалвелла-младшего сказал агентству Рейтер перед выходом их статьи, что его клиент "категорически отрицает все, что вы указали, что собираетесь опубликовать о нем".
В воскресенье Мистер Фалуэлл-младший опубликовал заявление в газете Washington Examiner, в котором заявил, что у его жены был роман и что мужчина, вовлеченный в него, угрожал "намеренно поставить в неловкое положение мою жену, семью и Университет свободы".
Он также говорил о" эмоциональном ущербе", который оказал на него этот роман.